VIEW:新型冠状病毒SARS-CoV-2的检测方法

2019年底在中国武汉爆发的新型冠状病毒肺炎COVID-19已经导致数千人死亡,数万人感染,迄今疫情仍然非常严峻。已报道的COVID-19的潜伏期最长为24天,感染病人在潜伏期无明显症状,但却可以传播病毒,因此对疫情防治的关键在于早发现、早隔离、早治疗。

核酸检测是目前诊断SARS-CoV-2(导致COVID-19的冠状病毒)感染的关键标准,然而,临床反馈目前的检测方法假阴性率高、灵敏性低。因此,来自武汉大学药学院、武汉大学人民医院检验科和武汉臻熙医学检验实验室的联合团队,结合近期SARS-CoV-2检测的实际情况,探讨了已形成的或有望形成检测SARS-CoV-2的相关方法的原理及应用范围,希望能够开发更多有效的SARS-CoV-2的检测方案及产品。

本文讨论了6种可行的方案,可分为非核酸检测和核酸检测。非核酸检测中最有望开发成为产品的是抗体免疫检测技术,目前有报道已形成相关检测产品,但该产品的准确性和灵敏性需要进行实际检验。用于SARS-CoV-2核酸检测的real-time RT-PCR方法是被世界各国推荐使用的鉴定方法,该方法成本较低、速度较快,但实际检测中已暴露出灵敏性低、假阴性率高的问题。全基因组测序虽然准确全面,但时间长,成本高,不满足现在这种紧急且大量样本的检测需求。已报道的可检测寨卡病毒和埃博拉病毒的“paper-based biomolecular sensors”和可检测寨卡病毒和登革热病毒的基于CRISPR/Cas技术开发的“SHERLOCK”技术快速、灵敏、简便,这两种方案都有望开发成为普筛的产品。本文作者研发团队已开发的纳米孔靶向测序(NTS)方案、可在8小时内一次性检测SARS-CoV-2和其余10种常见呼吸道病毒,可监测病毒变异情况,集快速、灵敏、准确、全面等特点为一体,成本较全基因组测序低很多,能够为目前SARS-CoV-2的检测和监测提供有效解决方案。

作者认为,real-time RT-PCR仍然是大型医院中使用最广泛的检测方法。而基于抗体的免疫测定技术,paper-based biomolecular sensors和基于CRISPR-Cas系统的方法(例如SHERLOCK)有望开发成为普筛检测产品,甚至可用于家庭检测。而NTS结合了灵敏度,全面性,快速检测和低成本的特点,使其成为检测其他方法无法有效诊断的可疑病毒感染或复杂感染的最适合方法。该文发表在VIEW上 (DOI: 10.1002/viw2.4)。

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